
Bisfenol türevleri, polikarbonat plastikler ve epoksi reçineleri üretmek için endüstriyel, ticari ve tüketici uygulamalarında yaygın olarak kullanılan fenolik bileşiklerdir. Bu bileşikler, çevre üzerindeki olası zararlı etkileri nedeniyle dünya çapında önemli bir endişe haline geldi. Bisfenol-A (BPA) en yaygın formdur ve Bisfenol-F (BPF) daha az zararlı bir alternatif olarak önerilmektedir. Bisfenol türevleri, diğer pek çok ekosistemde olduğu gibi, su ortamında kirliliğe neden olarak, canlı organizmalarda endokrin, boşaltım ve sinir sistemleri şeklinde birçok sorun yaratmaktadır. Asetilkolinesteraz enzimi, sinir sisteminin işleyişinde çok önemli bir role sahiptir ve ksenobiyotiklere karşı oldukça savunmasızdır. Bu projede, BPF’nin elektrikli yılan balığının (Electrophorus electricus) asetilkolinesterazı üzerindeki inhibitör etkisi hem in vitro hem de in silico olarak test edilecektir. Öncelikle, enzim aktivitesinin ölçümü için reaksiyon ortamındaki enzim, substrat, DTNB ve diğer kimyasalların konsantrasyon ve hacimleri optimize edilecektir. Test koşullarının optimizasyon süresinden sonra, kimyasallar doğrudan farklı konsantrasyonlarda saf enzime uygulanacak ve aktivite değişiklikleri tespit edilecektir. Bu değerler, inhibitör modeli elde etmek için lisanslı SigmaPlot.13 Enzyme Kinetics yazılımı ile analiz edilecektir. Önerilen modele göre, AutoDockTools-1.5.6, Chimera 1.14, UCSF ChimeraX-1.6.1, CBDock2 ve benzeri açık kaynak yazılımlar kullanılarak moleküler kenetlenme (docking), farklı GridBox konumları ile gerçekleştirilecektir. Bu molekülün enzim aktif bölgesinde veya muhtemel diğer bağlantı bölgelerinde hangi amino asitler ile etkileşimde olduğu çözümlenecektir.